本計畫主要係依據行政院環境保護署核定臺南、高雄、橋頭、屏東、嘉義園區之環評書件中施工、營運期間環境監測計畫辦理，計畫工作重點如下：

• 持續建立 、蒐集園區開發位址環境背景及鄰近環境品質監測站監測資料、規劃環境監測作業內容及品保品管計畫。
• 持續執行環境影響評估報告書中施工、營運期間環境監測工作。
• 環境監測結果說明與檢討。
• 研提 監測異常之因應對策與改進建議事項。

• 持續滾動式檢討園區地下水質監測井網，視需求設置地下水質監測井。
• 持續進行監測井維護作業，並定期量測園區監測井地下水位及掌握園區地下水流向。
• 持續進行地下水採樣與分析檢驗工作。
• 持續整合園區監測井及廠商自設井資訊。
• 持續調查蒐集園區事業單位貯存系統設置情形。
• 持續輔導園區事業執行「土壤及地下水污染整治法」第九條及其他土壤檢測相關事宜。
• 依據所採樣檢驗結果與監測資料，研提園區地下水污染防治工作應改進、變革之具體建議。

• 輔導入區事業提出各項環保許可申請，並提供相關環保諮詢服務。
• 調查/更新南部科學園區產業污染特性。
• 利用園區環境因子涵容能力與環境狀態指標（ECI）建立環境污染總量。
• 研擬園區總量管制架構並提出總量管制機制之建議。
• 依據ISO 14604盤查園區溫室氣體排放量，並依據園區及產業排放特性研擬可行減量措施。

依據「空氣污染防制法」第15條及「特殊性工業區緩衝地帶及空氣品質監測設施設置標準」(以下簡稱設置標準)，臺南園區(以下簡稱臺南園區)需依規定於適當地區設置空氣品質監測設施，進行空氣品質監測，爰自2015年監測至今，計畫工作重點如下：

• 於臺南園區設置4個空氣品質監測站，並建立完整環境監測管理系統，依規定進行各項空品監測。
• 完成空氣品質監測站維護工作，確保分析品質及運轉正常，提高監測站設備之妥善率與取得正確空氣品質監測數據。
• 藉由自動監測與人工手動監測，以瞭解臺南園區之空氣污染情況，有效掌握臺南園區空氣品質動態。